Em um mundo abandonado pelos deuses, a humanidade sobrevive entre ruínas e desertos. Sinedea, uma cidade-estado comandada pelo misterioso Governo sem Rosto, oferece uma segurança fria atrás de suas muralhas de aço. Nesse cenário, o soldado Levi cumpre ordens mecânicas enquanto questiona a falta de propósito em sua vida.
Longe dali, nas verdes terras de Cumdea - outrora chamada de Cidade de Deus -, a jovem Ayla vê seu lar desmoronar num levante sangrento. Ela carrega nos ombros uma herança secreta e perigosa: uma profecia ancestral que a liga ao destino de toda a humanidade.
Perseguidos por fanáticos religiosos e ameaçados pelos horrores de um mundo sem esperança, Levi e Ayla precisam desvendar os mistérios por trás da profecia e das forças sombrias que os cercam, além de confrontarem seus próprios medos e dilemas morais.